Phần mềm MM&S mô hình hóa cấu trúc hệ thống động với 4 nhóm yếu tố: nhóm yếu tố trạng thái, nhóm yếu tố trung gian, nhóm yếu tố không đổi, nhóm yếu tố liệt kê. Phần mềm cho phép vẽ sơ đồ mô phỏng cấu trúc (các yếu tố và tương tác giữa chúng), tính toán mô hình và vẽ đồ thị thời gian mô phỏng biến động các yếu tố hoặc vẽ đồ thị pha thể hiện tương quan biến động giữa hai yếu tố. Mô hình toán có thể được tích hợp vào sơ đồ mô phỏng hoặc soạn thảo dưới dạng tệp văn bản. Mô hình toán có thể được xuất từ sơ đồ mô phỏng sang dạng tệp văn bản.